Практикум 5:

Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка.

На картинке ниже вы видите перед собой систему водородных связей в составе парралельного бета листа.

phosphatase

Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот.

На картинке ниже вы можете видеть водородную связь образованную протонированным остатком гистидина и С=O группой тирозина при пептидной связи.

phosphatasewithoutligands

Солевые мостики.

На картинке вы можете видеть солевой мост длиной 2.1 ангстрем между заряженными групами аспартата и лизина.

secondary
Дисульфидная связь (отсутствует).

На картинке ниже вы можете видеть, что у щёлочной фосфатазы в составе есть лишь два остатка цистеина которые при этом сильно пространственно разнесены, в связи с чем водородная связь не образуется.

secondary
Стекинг.

На картинке представлены стекинговые взаимодействия между двумя остатками гистидина на расстоянии друг от друга в 3.5 ангстрем.

ligand