Для выполнения задания я выбрал белок с идентификатором P0AD49. Это белок из E. coli - ингибитор А, ассоциированный с рибосомами. При неблагоприятных условиях (чрезмерная плотность клеток на субстрате) ингибирует трансляцию, предположительно, связываясь с А-сайтом в рибосоме. При обычных условиях помогает связыванию субъединиц рибосом. Предотвращает димеризацию рибосом.
| Номер итерации | Число находок выше порога (0,005) | Идентификатор худшей находки выше порога | E-value этой находки | Идентификатор лучшей находки ниже порога | E-value этой находки |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 22 | Q49VV1.1 | 8e-04 | P19954.2 | 0.023 |
| 2 | 27 | O05886.4 | 1e-09 | Q9FJB5.1 | 0.40 |
| 3 | 27 | O05886.4 | 2e-24 | Q82IY7.1 | 0.20 |
Результат сошёлся на третьей итерации. Все белки из полученной выдачи являются факторами, ассоциированными с рибосомами и принадлежат одному семейству белков и являются гомологичными. Это семейство - HPF/YfiA белки ассоциированные с рибосомами. Ссылка на InterPro.