На заглавную страницу
На главную страницу второго семестра

Описание документа InterPro

  1. Идентификатор документа InterPro — IPR000119
  2. Его название — Histone-like bacterial DNA-binding protein
  3. Количество белков, в которых обнаружена данная подпись — 561

В документе были найдены следующие подписи:

Название базы данных Идентификатор Имя подписи Число белков
ProDom PD000945 Bac_DNAbind 513
Pfam PF00216 Bac_DNA_binding 549
PRINTS PR01727 DNABINDINGHU 461
PROSITE PS00045 HISTONE_LIKE 391
SMART SM00411 BHL 468

Данные 3 подписи могут быть описаны одной — IPR000119.
Первые 2 перекрываются с данной по белкам на 100%, третья — на 98%.
Зато по аминокислотам они не перекпываются мовсем.

Описание всех известных подписей в IHFA_ECOLI, собранных в БД InterPro

Название подписи Положение в последовательности IHFA_ECOLI Полное название базы данных Название организции, поддерживающей данную БДГород и страна
Bac_DNAbind 10-98 а.о ProDom Centre de Toulouse Франция, Тулуза
Bac_DNA_binding 3-92 а.о Pfam Sanger Institute Англия, Хингстон
DNABINDINGHU 42-57, 60-73, 76-90 a.o SPRINT University of Manchester Bioinformatics Education and Research Англия, Манчестер
HISTONE_LIKE 48-67 a.o prosite Swiss Institute of Bioinformatics Швейцария, Женева
BHL 3-92 a.o SMART European Molecular Biology Laboratory Германия, Хайдельберг
himA 2-97 a.o TIGR The Institute for Genomic Research США, Роквил
IHF_like_DNA_bnd 3-98 a.o Superfamily The Laboratory of Molecular Biology Англия, Кембридж

В начало

© Сахарова Ирина, 2005.