TMHMM result


# Sequence Length: 278
# Sequence Number of predicted TMHs:  6
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 136.13582
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  22.3793
# Sequence Total prob of N-in:        0.79291
# Sequence POSSIBLE N-term signal sequence
Sequence	TMHMM2.0	inside	     1    35
Sequence	TMHMM2.0	TMhelix	    36    58
Sequence	TMHMM2.0	outside	    59    72
Sequence	TMHMM2.0	TMhelix	    73    95
Sequence	TMHMM2.0	inside	    96   115
Sequence	TMHMM2.0	TMhelix	   116   138
Sequence	TMHMM2.0	outside	   139   157
Sequence	TMHMM2.0	TMhelix	   158   180
Sequence	TMHMM2.0	inside	   181   192
Sequence	TMHMM2.0	TMhelix	   193   215
Sequence	TMHMM2.0	outside	   216   238
Sequence	TMHMM2.0	TMhelix	   239   261
Sequence	TMHMM2.0	inside	   262   278

На графике вверху показаны трансмембранные сегменты (красные), внутренние (синие) и внешние (розовые) петли в последовательности.
Дополнительную информацию можно узнать по нижнему графику. Здесь представлены вероятности того, что тот или иной участок последовательности является трансмембранным сегментом, внутренней или внешней петлей. В соответствии с этим, в "консенсусную" линию выносится то событие, которое является более вероятным для каждого участка последовательности.
Кроме того, можно узнать, насколько интенсивным был каждый пик, разность между высотой пиков на каждом участке и, следовательно, вероятность того, что программа ошиблась в отношении того или иного сегмента, определяя его как трансмембранный, внутреннюю или внешнюю петлю.