Банк UniProt

Обязательные задания:

1.
  Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P0A873; P07020;
Идентификатор записи в БД ID TRMD_ECOLI Reviewed; 255 AA.
Название (краткое описание) белка DE tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase (EC 2.1.1.31) (M1G- DE methyltransferase) (tRNA [GM37] methyltransferase)
Дата создания документа DT 01-APR-1988, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot. DT 01-APR-1988, sequence version 1
Дата последнего исправления аннотации DT 05-FEB-2008, entry version 27
Число публикаций, использованных при создании документа RT 6
Журнал и год самой поздней публикации RL Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006)
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Cytoplasm; Direct protein sequencing; Methyltransferase; S-adenosyl-L-methionine; Transferase; tRNA processing
Что содержит поле комментариев? CC Информация о функции, каталитической активности, количестве субъединиц белка, положении внутри клетки, сходстве с белками других семейств, и др.
Идентификаторы записей PDB DR 1P9P

    2.
     Запрос  Число записей
    в SwissProt    		 Число записей
    в TrEMBL
    tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase 43596
    EC 2.1.1.31435265
    M1G-methyltransferase4230
    tRNA [GM37] methyltransferase4230

Дополнительные задания:

1.
  Метка поля Белок 1 Белок 2
Первый код доступа AC P0A873 Q1IMM4
Идентификатор последовательности в БД ID TRMD_ECOLI TRMD_ACIBL
Название (краткое описание) белка DE tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase (EC 2.1.1.31) (M1G-methyltransferase) (tRNA [GM37] methyltransferase) tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase (EC 2.1.1.31) (M1G-methyltransferase) (tRNA [GM37] methyltransferase)
Дата создания документа DT 01-APR-1988 31-OCT-2006
Дата последнего исправления аннотации DT 05-FEB-2008 02-OCT-2007
Название организма OS Escherichia coli (strain K12) Acidobacteria bacterium (strain Ellin345)
Классификация организма (список таксонов) OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia Bacteria; Acidobacteria; Acidobacteriales; Acidobacteriaceae
Длина последовательности SQ 255 AA 264 AA
Молекулярная масса белка SQ 28422 Da 29366 Da
Число публикаций, использованных при создании документа RT 6 1
Журнал и год самой поздней публикации RL Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006) Submitted (APR-2006) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases
Описание вторичной структуры FT В белке имеется 12 α-спиралей и 7 β-тяжей Описание отсутствует
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Cytoplasm; Direct protein sequencing; Methyltransferase; S-adenosyl-L-methionine; Transferase; tRNA processing Complete proteome; Cytoplasm; Methyltransferase; S-adenosyl-L-methionine; Transferase; tRNA processing
Темы, освещённые в комментариях CC Функции, каталитическая активность, количество субъединиц белка, положение внутри клетки, сходство с другими белками семейства, и др. Функции, каталитическая активность, количество субъединиц белка, положение внутри клетки, сходство с другими белками семейства, и др.
Особенности последовательности FT Наличие в белке одной цепи, участков связывания S-adenosyl-L-methionine, участков, на которых возможны мутации,одного поворота и элементов вторичной структуры: α-спиралей и β-тяжей Наличие в белке одной цепи, участков связывания c S-adenosyl-L-methionine
Идентификаторы записей PDB DR 1P9P Отсутствует

Второй семестр

©Черниогло Елена