Учебный сайт Николаевой Дарьи

Визуализация молекулы аспартатаминотрансферазы

После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:

1. Запустить скрипт:

2. Продолжить исполнение скрипта:

На представленной ниже Таблице 1 приведена информация о параметрах 3 случайно выбранных водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре белка аспартатаминотрансферазы (NP_214350.1)Aquifex aeolicus VF5: a. названиях и номере атомов, образующих связь (из какого остатка атом) b. длине связи (расстояние между азотом и кислородом) c. угле, образованном атомами N, O и C (остовный атом углерода, связанный с этим кислородом).
C результатами вычислений можно также ознакомиться в протоколе.
Таблица 1. Водородные связи между остовными атомами во вторичной структуре белка NP_214350.1 (аспартатаминотрансферазы) Aquifex aeolicus VF5.

Номер связи Азот Кислород Длина связи O-N (Å) Угол N-O-C (°)

1 [THR]228:A [CYS]247:A 3 161.1

2 [ASN]230:A [TYR]245:A 2.85 167.0

3 [ALA]188:A [GLU]184:A 3.03 151.1