Визуализация молекулы аспартатаминотрансферазы
На представленной ниже Таблице 1 приведена информация о параметрах 3 случайно выбранных водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре белка аспартатаминотрансферазы (NP_214350.1)Aquifex aeolicus VF5:
a. названиях и номере атомов, образующих связь (из какого остатка атом)
b. длине связи (расстояние между азотом и кислородом)
c. угле, образованном атомами N, O и C (остовный атом углерода, связанный с этим кислородом).
C результатами вычислений можно также ознакомиться в протоколе.
Таблица 1. Водородные связи между остовными атомами во вторичной структуре белка NP_214350.1 (аспартатаминотрансферазы) Aquifex aeolicus VF5.
| Номер связи |
Азот |
Кислород |
Длина связи O-N (Å) |
Угол N-O-C (°) |
| 1 |
[THR]228:A |
[CYS]247:A |
3 |
161.1 |
| 2 |
[ASN]230:A |
[TYR]245:A |
2.85 |
167.0 |
| 3 |
[ALA]188:A |
[GLU]184:A |
3.03 |
151.1 |
|