На главную страницу второго семестра alignment

Выравнивание вручную.

  1. Работа в FARе.

    В данной работе было предложено выравнить последовательности первых 60ти аминокислот из белков AMPA_ECOLI и его близкого мутната. В результате выравнивания, было введено 37 гэпов в положениях 20-50, 68-73. В итоге "вес" выравнивания составил 11. Он высчитывался по формуле W=M-X-G, где M - число позиций выравнивания,в которых обе буквы одинаковы, X - число позиций выравнивания , в которых буквы разные, G - число гэпов.
    Выравнивание в FARе

  2. Работа в GeneDoc.

    Здесь необходимо было выравнить полностью последовательность аминокислот из белка AMPA_ECOLI и из белка, схожего по функциям из организма Vibrio cholerae. Они оказались настолько сходными, что введение гэпов не потребовалось.
    Выравнивание в GeneDoc

©Попенко Анна