На главную страницу третьего семестра
Раздел EMBL | Индетификатор записи EMBL | Тип молекулы | Класс данных | Царство | Длина последовательности | Дата создания документа | Описание |
EMBL:U00096 | U00096 |
геномная ДНК |
STD |
PRO |
4639675 |
23.02.2006 |
Escherichia coli K12 MG1655, полный геном. |
EMBL:U14003 | U14003 |
геномная ДНК |
STD |
PRO |
338534 |
30.11.1994 |
Escherichia coli K-12 хромосомный участок с 92.8 до 00.1 минуты. |
EMBL:X15130 | X15130 |
геномная ДНК |
STD |
PRO |
2038 |
06.07.1989 |
E. coli xerB ген аминопептидазы A/I (EC 3.4.11.1) |
EMBL:X86443 | X86443 |
геномная ДНК |
STD |
PRO |
2232 |
06.11.1995 |
E.coli pepA/carP ген |
EMBL:AP009048 | AP009048 |
геномная ДНК |
STD |
PRO |
4646332 |
22.01.2006 |
Escherichia coli W3110 DNA, полный геном. |
Все находки относятся к стандартному классу данных. Длина последовательности варьируется от 2038 до 4646332(в случае полного генома).
Наиболее раннй документ создан 06.07.1989, последний добавлен относительно недавно - 23.02.2006. Полный геном Escherichia
coli K-12 представлен в документе U00096, также представлен полный геном другого штамма.
I | II | |
ID записи | X86443 | X15130 |
Начало гена в записи | 371 | 60 |
Конец гена в записи | 1882 | 1571 |
Направление гена | Прямое | Прямое |
Затем из этих файлов были извлечены последовательности, кодирующие белок AMPA_ECOLI:из X15130 и из X86443
Эти две последовательности были выравнены при помощи программы needle. Процент идентичности довольно мал - 81%. С первой по 311 позицию выравнивания на месте последовательности X15130 и с 2241 по 2349 на месте последовательности Х86443 стоят гэпы. Между этими значениями нет ни гэпов, ни замен.