Филогенетическое дерево

Задание 1

Отобранные бактерии:

Название Мнемоника Таксоны
Aromatoleum aromaticum AROAE cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Rhodocyclales; Rhodocyclaceae; Aromatoleum
Bordetella pertussis BORPE cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Bordetella
Escherichia coli ECOLI cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Neisseria meningitidis NEIMA cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria
Pasteurella multocida PASMU cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Pasteurella
Pseudomonas mendocina PSEMY cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas aeruginosa group
Serratia proteamaculans SERP5 cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Serratia

Скобочная формула дерева:
((((SERP5, ECOLI), PASMU), PSEMY), ((AROAE, BORPE), NEIMA));

Ветви дерева:
Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:
1) {SERP5, ECOLI}* против {PASMU, PSEMY, AROAE, BORPE, NEIMA};
2) {SERP5, ECOLI, PASMU} против {PSEMY, AROAE, BORPE, NEIMA};
3) {SERP5, ECOLI, PASMU, PSEMY}* против {AROAE, BORPE, NEIMA}*;
4) {SERP5, ECOLI, PASMU, PSEMY, NEIMA} против {AROAE, BORPE};
( * - нетривиальные ветви, выделяющие на дереве отобранных бактерий определенные таксоны)

Нетривиальная ветвь Таксон
{SERP5, ECOLI}* Порядок Enterobacterales
{SERP5, ECOLI, PASMU, PSEMY}* Класс Gammaproteobacteria
{AROAE, BORPE, NEIMA}* Класс Betaproteobacteria

© Макиевская Кьяра, 2019