Построение и анализ дерева, содержащего паралоги

Задание 4

При помощи локального BLAST (blastp) была получена группа белков, гомологичных CLPX_ECOLI.
Был получен общий файл с последовательностями и файл с выравниванием (построено с помощью MUSCLE). Файл с выравниванием был загружен в программу MEGA, где производилось построение дерева с помощью UPGMA.

Оттенками красного и оранжевого отмечены ортологи. Оттенками голубого и синего - паралоги.


© Макиевская Кьяра, 2019