Краткое описание генома вируса Jatropha mosaic virus

Краткий обзор вируса

Вирус, изучаемый мной, относится к роду Begomovirus. Вирусы данного рода имеют две кольцевые одноцепочечные молекулы ДНК (ssDNA), колирующие 7-8 пептидов (в моём случае 7). ДНК защищена икосаэдрическим капсидом с симметрией T=1. Диаметр капсида 15-18 нм [3]. В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие вид Jatropha mosaic virus.

Вирусы этого рода имеют большой диапазон поражаемых растений из класса двудольных. Но основным хозяином Jatropha mosaic virus (JMV) является Ятрофа, эфирно-масличное растение, которое активно разводят в Индии и Китае. От растения к растению вирус передаётся посредством Табачной белокрылки, которая является универсальным переносчиком практически всех представителей рода. При попадании в организм растения, вирус вызывает симптомы, схожие с симптомами других представителей MV: появление на листьях мозаикоподобного рисунка тёмно-зелёного рисунка, сморщивание их и деформация (Рис.1) [3]. Механизм заражения JMV типичен для всех ssDNA-вирусов и включает в себя следующие стадии (Рис.2):

1. Проникновение вирусной частицы в клетку
2. Проникновение ssDNA вируса в ядро клетки
3. Репликации ssDNA в dsDNA посредством молекулярных машин клетки
4. Транскрипция, трансляция и репликация, происходящая по механизму катящегося кольца.
5. Копии ДНК могут:

Белки, синтезируемые вирусом

Хочется заметить, что вирус кодирует в своём геноме лишь 7 белков, хотя другие представители того же рода имеют 8 белков [2]. В итоге наименьший размер имеет продукт гена AC4, белок, роль которого заключается в подавлении эффекта РНК-сайленсинга [5]. Ниже представлена его последовательность.

Последовательность белка AC4

>YP_009026404.1 AC4
MRMGSLISMCSYSSKGSTTARITDSSIWSPQHGQHISIRTYRELNRAPTSSPTSTRTEIH
WNGENSRSTDEVLGEAANLLMIHMPRR