Анализ крупных перестроек
Сходство геномов
Для сравнения были взяты геномы Mycoplasma fermentans, результаты анализа сходства представленны ниже.
| 1 геном | 2 геном | ident | Длина участков |
| CP001995.1 | CP002458.1 | 94,33794503 | 1211768 |
| CP001995.1 | AP009608.1 | 94,33274211 | 1142822 |
| CP002458.1 | AP009608.1 | 94,60448554 | 1420434 |
Карты сравнения CP001995.1 CP002458.1 и AP009608.1 представлены ниже
CP002458.1 и CP001995.1
AP009608.1 и CP001995.1
AP009608.1 и CP002458.1
Анализ
Вставка
Можно заметить, что CP001995.1 имеет вставку на 564909:587776. Можно понять, что это вставка потому, что на графике AP009608.1 и CP002458.1 в этом месте не имеется разрывов. В связи с отсутствием знания чего-либо о предковых организмах, это - единственный способ узнать о том, делеция это, или вставка. Да и сам фрагмент содержит в основном гипотетические протеины.
© Попов Алексей, 2016 г.
