Прочтение последовательностей по Сэнгеру

Задание 1

Для начала представлю 3 последовательности fasta. Прямая , обратная и полная , как того требует задание. Хочется отметить, что на полной последовательности маленькими буквами быделены места, различные на двух хроматограммах.

Далее представленна таблица со сравнительными признаками этих двух хроматограмм.

Параметр	R	F
Оценка отношения шума и сигнала	Примерно 1/5	Примерно 1/10
Неравномерность силы сигнала и шума	Довольно равномерно и красиво	Неравномерное распределение, есть места, в которых сигнал равен шуму
Длина начального нечитаемого участка	55	160
Длина конечного нечитаемого участка	80	55

Далее представленна таблица с проблемными нуклеотидами и краткие обоснования выбора.

A возвышается над шумом

T возвышается над шумом

T возвышается над шумом

AT, так как видно, что продолжения - пятна

А по этой ссылке вы можете посмотреть на проект JalView с выравниванием этих двух последовательностей.

Нечитаемый фрагмент

Для разрешения проблемы был взят фрагмент посреди хроматограммы прямой последовательности. Видно, что между 80 и 87 нуклеотидами располагаются пятна краски, оставшиеся от 84 и 87 нуклеотидов. Подробнее в эту проблему вы можете окунуться с помощью картинки, расположенной ниже.