Описание холинтриметиламинлиазы из генома Desulfovibrio alaskensis G20.
Desulfovibrio alaskensis относится к сульфат-редуцирующие бактериям.
D. alaskensis обладает способностью редуцировать радионуклиды и тяжелые металлы, такие как уран и хром, до растворимых и менее токсичных форм. Штамм G20 D. alaskensis представляет собой анаэроб с оптимальным температурным диапазоном 25 ° C-40 ° C. Это грамотрицательная бактерия, имеющая форму стержня, не продуцирует эндоспоры и представлен отдельными клетками. Этот штамм, насколько известно, не вызывает никаких заболеваний.Основная информация о белке
В таблице приведена основная информация о белке холинтриметиламинлиаза. Данная таблица позволяет лучше разобраться в его особенностях.
| Идентификатор белка | ABB40076.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | CP000112.1 |
| Название белка | Choline trimethylamine-lyase |
| Координаты гена в геноме | 1..846 |
| Длина гена (п.н.) | 2541 |
| Цепь | Обратная |
| Длина белка (а.о.) | 846 |
Белок был получен методом секвинирования. Аминокислотная последовательность
Уменьшающие сульфат бактерии оказывают важное влияние на экономику, потому что они вовлечены в биокоррозию черных металлов в анаэробной окружающей среде. Например, у их метаболизма есть несколько негативных последствий для нефтяной промышленности (например, коррозия оборудования для перекачки). Эти бактерии также способствуют биоисправлению токсичных металлических ионов. Модификация свойств растворимости, вызванных изменением в состоянии окисления-восстановления металла, представляет себя как потенциальный путь для биоисправления загрязненных грунтовых вод или почв.
Геномное окружение белка
Рассмотрим геномное окружение белка, чтобы лучше понять его функции и значение для бактерии.
По ходу выполнения работы возникло огромное множество трудностей, преодолевая которые я становился умнее и счастливее!