Практикум 9. EMBOSS

Задание №4. Parser_gb.sh

Описание: по данному аннотированному файлу в формате .gb (из GenBank или RefSeq) создаёт с кодирующими последовательностями в формате fasta, добавив в описание каждой последовательности функцию белка (из поля product).

Ссылка на скрипт: parser_gb.sh

Скрипт принимает два аргумента: названия входного файла и выходного файла.

Пример использования:

 crasyempress3090@kodomo:~/public_html/term3$ bash parser_gb.sh pr9.gb outpr9.fasta 

Входящий файл: pr9.gb

Выходящий файл: outpr9.fasta