Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
Фрагмент последовательности | I-I-Y-F-L-C-T-G-N-S-C-R-S-Q | 4 | Логично, что нет |
Сильный | [IDKRNT]-I-[YILT]-[FV]-[LV]-C-[TVI]-G-N-[STI]-C-R-S-[QP] | 37 | да |
Слабый | I-[YILT]-[FV]-[LIV]-C-[TVIL]-G-N-[STIL]-C-R-S | 57 | да |
Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00005 | PKC_PHOSPHO_SITE | Protein kinase C phosphorylation site | Паттерн | [ST]-X-[RK] | нет | 2 |
PS00008 | MYRISTYL | N-myristoylation site | Паттерн | G-{EDRKHPFYW}-X(2)-[STAGCN]-{P} | нет | 2 |
PS00001 | ASN_GLYCOSYLATION | N-glycosylation site | Паттерн | N-{P}-[ST]-{P} | нет | 1 |
PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Casein kinase II phosphorylation site | Паттерн | [ST]-X(2)-[DE] | нет | 1 |