Эволюционные домены. БД Pfam, InterPro.

1. Доменная структура белка arsC_BACSU по данным Pfam

   Cхема из Pfam:
   Пояснения к схеме
   №	Pfam AC	Pfam ID	Полное название семейства доменов	Положение в последовательности белка arsC_BACSU	Клан
   1.	PF01451	LMWPc	Низкомолекулярная фосфотирозин протеинфосфатаза	3-139	n/a

   
   



2. Представленность домена PF01451 в организмах разных видов

   Таксон		Количество белков с доменом PF01451.
   Эукариоты	Зеленые растения	9
   	Грибы	57
   	Животные	-
   	Остальные эукариоты	51
   Бактерии		1256
   Археи		33




3. Представленность изучаемых доменов в белках Bacillus subtilis

   №	PFAM ID	Bacillus subtilis
   1.	LMWPc	arsC_Bacsu, yfkJ_Bacsu, ywlE_Bacsu

   
   2782 белка имеют такую же доменную организацию.
   
4. O30241_Arcfu - регуляторный белок экспрессии lacZ
   B3DWR0_Meti4 - гидроксиметилтрансфераза серина (?)
   Q0RKE8_Fraaa - предполагаемая арсенатредуктаза
5. Выравнивание затравки.


6. 
   
   
   Структурные подписи.
   
   Самый короткий мотив - IPR017867. Он еще описан в базе данных PANTHER - PTHR11717
   Самый длинный мотив - IPR017867. Он еще описан в базе данных Superfamily - SSF52788
   Да, граница структурного мотива отличается. Structural features в 1JL3A - 1-139, PF01451 - 6-139.