Эволюционные домены. Pfam.


Домен pf01451 - белкова тирозин-фосфотаза. PTPs - это группа ферментов, которые убирают фосфатные группы с фосфорилированных тирозинов различных белков. Такие реакции крайне важны в различных сигнальных путях.
Всего существует 3717 последовательностей с данным доменом в 1838 видах.
В археях представлена 51 последовательность в 40 видах, у бактерий - 3424 последовательности в 1666 видах, у эукариот - 237 последовательностей в 133 видах.
http://pfam.janelia.org/family/PF01451#tabview=tab7
- одна из архитектур, с доменом PF01300. К сожалению, в списке возможных архитектур не представлена вторая - с доменом PB018881 :(



Разным цветом обозначены разные доменные архитектуры. Видно, что разделение на эти две группы дало существенную разницу в последовательностях каждой из групп.
©