EC/KEGG

  1. Мой белок - ARSC_BACSU - является арсенатредуктазой и тирозин-фосфотазой.
    Его код как арсенатредуктазы - EC 1.20.4.-
    1 - Oxidoreductases/оксидредуктаза
    20 - Acting on phosphorus or arsenic in donors/использует арсенаты или фосфор в качестве донора
    4 - With disulfide as acceptor/дисульфид в качестве акцептора
    Reaction: arsenate + glutaredoxin = arsenite + glutaredoxin disulfide + H2O



    Код как тирозинфосфатазы - EC 3.1.3.48
    3 - Hydrolase/гидролаза
    1 - Acting on ester bonds/действует на эфирные связи
    3 - Phosphoric Monoester Hydrolases/фосфорные моноэфир-гидролазы
    48 - protein-tyrosine-phosphatase/белковая тирозин-фосфотаза
    Reaction: protein tyrosine phosphate + H2O = protein tyrosine + phosphate


  2. К сожалению, для моего фермента на сайте не представлено никаких метаболических путей(


  3. Сукцнат - succinate
    Идентификатор C00042




    Фосфоенолпируват - phosphoenolpyruvate
    Идентификатор C00074



  4. Выбранная цепочка ферментативных реакций:
    Путь: цикл трикарбоновых кислот
    цепочка: сукцинат → фосфоенолпируват



  5. Организм Возможна ли цепочка реакций
    (да/нет/неизвестно)    		 Обоснование
    Escherichia coli K-12 MG1655 да не хватает того фермента, функцию которого могут выполнять два разных
    Archaeoglobus fulgidus нет у этого организма нет фермента, который делает фосфоенолпируват из оксалоацетата
    Arabidopsis thaliana да не хватает лишь одного фермента, причем в том месте, где их нужно два (или это значит, что можно один из двух?..)
    Homo sapiens да аналогичное объяснение


  6. Было найдено 2 белка - один у человека, другой у археи.
    У этих белков одинаковая доменная организация:



    Результаты поиска лучших ортологов из противоположных групп дали следующие результаты - pho:PH0726для человека и rcu:RCOM_1595060 для Archaeoglobus fulgidus.
    То, что для таких далеких родственников, как архея и человек, у меня получилась абсолютно одинаковая доменная организация, довольно странно. Эти ферменты - карбамоилтрансферазы диаминовалериановой кислоты. Видимо, данная реакция у этих организмов происходит одинаково, потому и архитектура не изменилась.
©