Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS

Были получены 5 pdb файлов для разных методов:

et_be.pdb - метод Берендсена для контроля температуры.

et_vr.pdb - метод "Velocity rescale" для контроля температуры.

et_nh.pdb - метод Нуза-Хувера для контроля температуры.

et_an.pdb - метод Андерсена для контроля температуры.

et_sd.pdb - метод стохастической молекулярной динамики.

В методе Берендсена молекула этана вращается вокруг C-C связи и вокруг ее середины. Длины связей почти не меняются.
В методе "Velocity rescale" меняются длины всех связей, молекула очень хаотически крутится.
В методе Нуза-Хувера молекула только вращается вокруг оси C-C связи.
В методе Андерсена молекула как бы дрожит, никаких изменений не видно.
В методе стохастической молекулярной динамики молекула носится по всему экрану, что-либо понять вообще сложно.

Метод	Энергии	С-С
be
vr
nh
an
sd