Работа с Pymol
Зона контакта лиганда с белком.
На мой взгляд, стоит промутировать Asn46 и Asp52 на Gly.
На этой картинке малиновым (справа) помечены новые глицины. А они ну никак не могут отвечать за связывание лиганда, так как глицин незаряженный, его радикал нейтрален и очень маленький.
TAMRA, связанная с белком 1lmp через сложноэфирную связь с -OH группой Ser81.
Скрипт, создающий спираль из 100 аланинов.
© Свистунова Даша