Cherry leaf roll virus - вирус, поражающий растения семейства Secoviridae порядка Picornavirales рода Nepovirus.
Вирус, имеющий вид изометрических частиц (28 нм в диаметре). Распространен среди многих диких и культурных видов древесных растений в Европе, странах бывшего СССР, Северной Америке и Новой Зеландии. . Он легко передается посредством механической инокуляции сока и через семена потомству естественно или искусственно зараженных растений. Вирус также шикоро применяется в экспериментальных целях и показывает достаточно много черт неповирусов, однако не переносится нематодами. Имеются свидетельства того, что как минимум несколько штаммов могут передаваться с пыльцой опыляемым растениям.[1]
Основные характеристики вируса приведены в таблице1
| Основные пареметры генома вируса Cherry leaf roll virus [2] | |
| Параметр | Значение |
| Латинское название вируса | Cherry leaf roll virus |
| Русское название вируса | нет |
| Количество фрагментов в полном геноме | 2 |
| Общая длина генома | 14278 |
| Количество кодируемых в геноме белков | 2 |
Последовательность аминокислотных остатков белка polyprotein 1, кодируемого геномом вируса [2]
>gi|330444749|ref|YP_004382746.1| polyprotein 1 [Cherry leaf roll virus] MVKPTVFSNGESVLPKALISEAREVAAFLKSTRNPAGFWVTFVAQGTSLSVSQVALCAINGIVCRQSVES HSNGPSAVAYWSALRAKLRSFLKGHGRWVTSLLAKCAEIFESRDLCRYQRQRAAYLARGAALRAKALKKR KVALQKERATQLAQRQLEGERRAAARREREARKGLQTLRRKLAALFCPPPPFPTTEWGWDFLPSSPLPAY RDFFTSPLLEEASVAPPPVGPVGFNKSTPQALYVSVRARLATFSKATGALFPLVDYDRFCPGHLMMFQLM HRLVAAYMACPVLSLVEDGLGALLRGDDYLFVFKNMMVAATQVVNKLSTCGRSAMQVQAGFGISNFFRGV GNSLASGFFEGARQSAIDAKDFIIDGINWTADKTVGAFVRALRDEFSNSVGKYLNAVSEYKAQIENFWAW AVRWSNNLMNKVDVSLRALQGSAFFAAALVIVGGIVYLIENLLPPAATGLPIGSLSSLFVGGALLFWCGS ELFQNEKVMNIRVAIVTMAERMFSKNKAVQSGNMTVQAGIQDIFGVPLTLMETIGSGLCGSALSSMTYVG KFGQAMDNIRKGVMCMRQFLGWMLEQLAELYDNVSGRKVAFFRELATLAQVDVEKWISDVQEFLLVAEVA PEGDRVILDTVLLLLNKGHTIQRLLCQTKQGTSFNYGRLVATLVKSLDDVYTKYTKAGRRVMYRFVPFWA YFFGKARTGKTIFANNFKNTMVQYLGTTSENIFYKNARDQFWPKYRQQAIVIVDDLSAVENPPSLESEFI QLMSTMPYGLNMAAVDEKGSEFNSKMVITTSNKYTAPSCAKIHDMDAFNLRRHACVEVRRIEGVLYDPKN PYLSSEARFVNNQDQAPEGEWMAMEQMQEELIARYQRHHEAQVDEYNFWKKNARNTHDVFDILEEKIKEE GFWLSSAEFCMPDRASQGVSAADRFLGVDGKIIKYDALSFEGAYFDGKHLAKSAQDLEHLAMVKYHEFSD LLRAWSVNGVVRQFMEQLLTGPTHVDSANALNLDALPSHREFFDSMTLPKRAVLRLIQKKVDMIKAGPAF EFTPTKGFTLAKVLKDGYDYVYNNGGKIFLIFAAVVILWFLCGTAMHLLRQIFCGGVGAGSAGAMMKMSV QSTIPSGSDVQSYASRNLRRVYRPTRLGLQSAMNPVETVSQAEQLMAWIDTPQGNLISCCRFKARSLAMT YHQARAIAPGAKIFITYMTAAGTPSVPLEHIWDPQETAPTPNLRRFNDTEVCVYTHPQLSPLPGPLESMF VEDMQAGPSVYHIEGRVMKLVRDSHEFLPNDFVGAPEEIVPHVWSGVVHLNTHALTIDNYKWGGDYKINI PRSLVGSYPNAKEDCGGLLFAKIHNSYKVIGMHVSGEQLADGSYLSAAALLPRPSLFMSAQSGLRTLTIE AGKDTRGVSKVGFIKAEEIPRAPRKSSFIEVEEELKVPVPPGVPLKQIAILSNSDERLKGTQFEGYDPLR QATVKCEDPMFDLRSDVLEDVLEDVLETWFDCAPSLSLLSDEEMVNGNDEEVFLDAVVHSTSEGYPYVLE RGPGEKGKERYLEQDPALPEGKLRVRPGTSVHRDLLALEKSIHFTIPILVGMEIPKDERLKESKILTPAT RTFTVLPMPYNLLLRKYFGRCVAFLQGNRHRLPCAVGINPYSNEWTRIFDGLARVSPKALNGDYKGFDGK LNFQMYDAIARLLCCLHRDESTSTARYNLILAMYARYSLCGSQVYEVRAGLPSGCAITVIMNSIFNEILI RYAYRVSVGPILRNRFSHFVKLIVYGDDNLIAVDPQLASGTFAGYEGGKMVVTDVFDGATIQKVLAQVNI TITDGSDKNAKEWHFKSLESLDFLKRGFKRMADGRVLAPLDLSAIFSSLHVVRPDQGSTAAAVNINARVA LRELWLHQDQNLFEMVREFYKRHNFVDLPTWRECRDFHQSQYSEWQPFKEYKFLELPLPEQENREFMENH ATRKSVCVVADQTIVVGPAWKPSNPEGFFVVDLLGPTCGRGGNVTNIPTYGDGSGRLGTATWVRNWRSAK KQPIVQLAIQARKEGKIIAFRDAAPFLNGWNAAIAFCEGLGMDSNDLIAVYSRSGGLHRSLIERNFKAAS FEPRKVAPGVFA |
Источники:
© Кучеренко Варвара 2015