Uniprot и Refseq Protein

Информация о белке NP_820762.2 в базе данных UniProt

Таблица 1. Описание фосфоглицераткиназы из генома бактерии Coxiella burnetii RSA 493 в базе данных UniProt

UniProt ID	PGK_COXBU
UniProt AC	Q83AU6
RefSeq ID	NP_820762.2
PDB ID	4NG4
Длина (в аминокислотных остатках)	391
Молекуларная масса (в дальтонах)	42363
Рекомендуемое UniProt название (DE: Recname Full)	Phosphoglycerate kinase
Состояние	Reviewed

Комментарий к таблице:
Известна структура всего белка (секвенирована 01-JUN-2003);
В записях PDB представлены 3 цепи;
Белок катализирует реакцию переноса фосфорного остатка с ATP на 3-фосфо-D-глицерат (участвует в гликолизе)

Таблица 2. Кластеры Uniref для белка NP_820762.2

Кластер	Идентификатор кластера	Название кластера	Количество белков в кластере	Организмы, для которых характерны данные белки
Uniref100	UniRef100_Q83AU6	Cluster: Phosphoglycerate kinase	3	Coxiella burnetii (strain RSA 493 / Nine Mile phase I); Coxiella burnetii
Uniref90	UniRef90_Q83AU6	Cluster: Phosphoglycerate kinase	8	Coxiella burnetii (strain RSA 493 / Nine Mile phase I); Coxiella burnetii; Coxiella burnetii (strain Dugway 5J108-111)
Uniref50	UniRef50_Q8XD03	Cluster: Phosphoglycerate kinase	1894	Escherichia coli O157:H7; Escherichia coli; Escherichia coli O55:H7 (strain CB9615 / EPEC); Escherichia coli 3.4880; Escherichia coli O157:H7 (strain EC869); Escherichia coli O157:H7 str. SS52; Escherichia coli Xuzhou21; Escherichia coli (strain UTI89 / UPEC); Escherichia coli D9; Citrobacter koseri (strain ATCC BAA-895 / CDC 4225-83 / SGSC4696) И т.д.

Поиск в Uniprot

Поиск по рекомендованному названию (name:"Phosphoglycerate kinase")
Было найдено 15414; Из них 736 в статусе Rewiewed
Поиск рекомендованному названию среди белков организмов того же семейства(name:"phosphoglycerate kinase" taxonomy:coxiellaceae)
Было найдено 7 белков; Из них 1 в статусе Rewiewed
Поиск рекомендованному названию среди белков организмов того же отдела(name:"phosphoglycerate kinase" taxonomy:proteobacteria)
Было найдено 5010 белков; Из них 290 в статусе Rewiewed
Поиск по названию hemoglobin(name:hemoglobin)
1. Без ограничений
  Было найдено 7471 белков; Из них 944 в статусе Rewiewed
2. В таксоне Vertebrata(name:hemoglobin taxonomy:vertebrata)
  Было найдено 1642 белков; Из них 821 в статусе Rewiewed
3. В таксоне Arthropoda(name:hemoglobin taxonomy:arthropoda)
  Было найдено 747 белков; Из них 0 в статусе Rewiewed
Поиск по названию trypsin(name:trypsin)
1. Без ограничений
  Было найдено 10833 белков; Из них 301 в статусе Rewiewed
2. Среди ингибаторов (name:trypsin name:inhibitor)
  Было найдено 2588 белков; Из них 2588 в статусе Rewiewed

Источники:

Сайт UniProt
NCBI Taxonomy

Назад
На главную