Ниже представлен сравнительный анализ протеомов С.burnetii RSA493 и E.coli K12 по встречаемости аминокислотных остатков.
Протеом С.burnetii RSA493 (Proteome ID UP000002671) состоит из 1781 белка (506095 остатка)
Протеом E.coli K12 (Proteome ID UP000000625) состоит из 4306 белка (1356086 остатка)
| Аминокислотный остаток | Частота встречаемости в протеоме Coxella burnetii (штамм RSA493), % | Частота встречаемости в протеоме Escherichia coli (штамм K12), % | Разница встречаемости,% |
| L | 11,0078 | 10,6726 | 0,3352 |
| A | 8,0807 | 9,5154 | 1,4347 |
| I | 7,3822 | 6,0103 | 1,3719 |
| G | 6,3731 | 7,3746 | 1,0015 |
| V | 6,2587 | 7,0734 | 0,8147 |
| K | 6,2407 | 4,4061 | 1,8347 |
| E | 6,0327 | 5,7628 | 0,2698 |
| S | 5,9317 | 5,8023 | 0,1294 |
| R | 5,3464 | 5,5110 | 0,1646 |
| T | 5,1328 | 5,3991 | 0,2662 |
| F | 4,5416 | 3,8905 | 0,6512 |
| D | 4,5375 | 5,1510 | 0,6135 |
| P | 4,4262 | 4,4254 | 0,0009 |
| N | 4,1765 | 3,9454 | 0,2311 |
| Q | 4,1704 | 4,4401 | 0,2698 |
| Y | 3,3075 | 2,8453 | 0,4622 |
| H | 2,4217 | 2,2664 | 0,1553 |
| M | 2,3110 | 2,8193 | 0,5083 |
| W | 1,2027 | 1,5312 | 0,3284 |
| C | 1,1180 | 1,1576 | 0,0396 |
| U | 0,0000 | 0,0002 | 0,0002 |
Комментарий к таблице:
Наиболее часто встречаемые остатки в протеоме Coxiella burnetii RSA493: L (лейцин), A (аланин), I (изолейцин); Наиболее редко встречаемые: M (метионин), W (триптофан), C (цистеин)
Наиболее часто встречаемые остатки в протеоме Escherichia coli K12: L (лейцин), A (аланин), G (глицин); Наиболее редко встречаемые: W (триптофан), C (цистеин), U (селеноцистеин - осутствует у Coxiella burnetii RSA493)
Наибольшая разница в частоте встречаемости наблюдается по остатку K (лизин)
© Кучеренко Варвара 2015