Для выполнения заданий из базы данныз UniProt были взяты белки со следущими ID:
С помощью редактора последовательностей JalView (File->Input Alignment->From File) было построено множественное выравнивание программой Muscle с параметрами по умолчанию (Web Service->Alignment->Muscle with defaults). Последовательности были предварительно скачаны с UniProt.
Последовательность с ID Q6M150_METMP негомологична остальным, т.к. при множественном выравнивании без нее количество консерваливных колонок увеличилось(N- и C- концевые участки также оказались негомологичны и были удалены из последовательностей)
Изображение выравнивания, полученного в задании 2, в раскраске BLOSUM62 с порогом по консервативности 30%
Файлы:
Project
Exercise 2(fasta)
Exersice 2(msf)
© Кучеренко Варвара 2015