• Род - Bacteroides, вид -Thetaiotaomicron, штамм - VPI-5482


• Домен - Bacteria


• Идентефикатор RefSeq - NC_004663.1 (Хромосомная ДНК), NC_004703.1 (Плазмида).


• ДНК - кольцевая хромосома + плазмида


• Длина последовательности полного генома - 6.293038 МБ (мегабаз): 6.26 МБ в хромосоме и 0.033038 в плазмиде


• Число генов, кодирующих белки - 4816 (4778 в хромосоме и 38 в плазмиде)

Является типовым штаммом вида B. Thetaiotaomicron. Bacteroides — род грамотрицательных анаэробных палочковидных бактерий семейства Bacteroidaceae. Представители рода Хемоорганогетеротрофы, облигатные анаэробы, не образуют спор, имеют полисахаридную капсулу, состоящую из двух полисахаридов. Являются представителями нормальной микрофлоры кишечника, вовлечены в процессы сбраживания углеводов, утилизации белков и биотрансформации жёлчных кислот.

Окружение гена NP_812675 в геноме бактерии

Ген NC_812675.1 и его ближайшие соседи на Рис1.

• BT_3764:
  • Длина: 1257 bp
  • Направление: +1
  • Рамка считывания: +0
  • Кодирует белок L-rhamnose isomerase длиной 418 аминокислот
• BT_3765:
  • Длина: 1020 bp
  • Направление: +1
  • Рамка считывания: +0
  • Кодирует белок rhamnose-proton symporter длиной 339 аминокислот, транспотрирующий L-рамнозу и L-ликсозу в клетке
• BT_3763
  • Длина: 1458 bp
  • Направление: +1
  • Рамка считывания: +1
  • Кодирует белок rhamnulose kinase/L-fuсulose kinase длиной 485 аминокислот

Обсуждение:

• Все описанные гены входят в один оперон, тк все они отвечают за синтез сахара рамнозы, и должны транскрибироваться вместе

Рис1.- Ген, кодирующий изомеразу рамнозы, и его "соседи"

Назад к странице семестров