Водородные связи между белком и ДНК. Белок в движении

После того, как структура загрузится, надо нажать кнопки:

1. Запустить скрипт

2. Продолжить исполнение скрипта:

Text of the script for 1st task
Text of the script for 2nd task

Водородные связи между белком и ДНК

Скрипт Hbonds показывает водородные сязи между белком и молекулой ДНК, с которой он взаимодействует. Молекула ДНК покрашена оранжевым цветом, остов белка серый, водородные связи - фиолетовые. Водородные связи необходимы для удержания белка - эндонуклеазы в нужно позиции на молекуле ДНК.

Подвижность атомов в молекуле белка

Атомы остатков, входящих в состав спиралей и тяжей, менее подвижны, чем атомы из петель, при этом атомы остова менее подвижны, чем атомы боковой цепи.

Остаток	Положение	Максимальное расстояние между моделями удалённого от остова атома, нм	Максимальное расстояние между моделями остованого атома, нм
[ARG]78:A	Тяж	8.394786	1.1871058
[PHE]77:A	Тяж	8.079745	1.2589841
[PHE]65:A	Тяж	3.7097442	0.717802294
[GLU]2:B	Петля	5.494933	2.6088414
[SER]45:A	Петля	4.497014	2.0454798
[SER]54:A	Петля	5.0591593	3.9215255

Назад к странице семестров