← назад

Практикум 3

PDB ID - 6YTE; UniProt ID - P49759

Структура в целом

В данном практикуме рассматривается Белок - Dual specificity protein kinase CLK1.

В его структуре присутсвует одна полимерная цепь.

img1

Цепь

Данный белок относится к Homo sapiens. UniProt ID - P49759.

Функция протеинкиназы двойной специфичности CLK1 (Dual specificity protein kinase CLK1) - 2.7.12.1 EC. Белок фосфорилирует серин- и аргинин-богатые (SR) белки сплайсосомального комплекса и может быть составной частью сети регуляторных механизмов, позволяющих SR белкам контролировать сплайсинг РНК. Также он регулирует альтернативный сплайсинг пре-мРНК тканевого фактора (F3) в эндотелиальных клетках.

В данном белке есть мутация относительно референса из UniProt. На 287й позиции вместо Аргинина находится Аланин.

img2

Малые молекулы

В записи присутствует такая малая молекула как: EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one.

Данная молекула является лигандом.

Новый файл со строками о EAE из pdb - EAE.pdb

img3