Практикум 3
PDB ID - 6YTE; UniProt ID - P49759
Структура в целом
В данном практикуме рассматривается Белок - Dual specificity protein kinase CLK1.
В его структуре присутсвует одна полимерная цепь.
Цепь
Данный белок относится к Homo sapiens. UniProt ID - P49759.
Функция протеинкиназы двойной специфичности CLK1 (Dual specificity protein kinase CLK1) - 2.7.12.1 EC. Белок фосфорилирует серин- и аргинин-богатые (SR) белки сплайсосомального комплекса и может быть составной частью сети регуляторных механизмов, позволяющих SR белкам контролировать сплайсинг РНК. Также он регулирует альтернативный сплайсинг пре-мРНК тканевого фактора (F3) в эндотелиальных клетках.
В данном белке есть мутация относительно референса из UniProt. На 287й позиции вместо Аргинина находится Аланин.
Малые молекулы
В записи присутствует такая малая молекула как: EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one.
Данная молекула является лигандом.
Новый файл со строками о EAE из pdb - EAE.pdb