Подбор пары нуклеотидных последовательностей.

Для сравнения были взяты два штамма бактерии Fusobacterium animalis - наиболее распространённого подвида вида Fusobacterium nucleatum

Поиск производился на сайте NCBI по запросу (chromosome[Title] AND "Fusobacterium"[Organism]) AND "Fusobacterium animalis"[porgn] AND refseq[filter]

Fusobacterium animalis strain KCOM3127 chromosome, complete genome NZ_CP084141.1

Fusobacterium animalis strain KCOM2877 chromosome, complete genome NZ_CP084149.1

Карты локального сходства.

Параметры megablast и blastn оставлены по умолчанию.

Карта, полученная в результате работы megablast, имеет меньше "грязи", поскольку по умолчанию в этом алгоритме используется большая длина слова.

blastn - Query Cover 86%, Per. Ident 98.04%

megablast - Query Cover84%, Per. Ident 98.50%

Несмотря на наличие похожих участков хромосома претерпела довольно много инверсий и транслокаций.