Этот практикум будет посвящен гену загадочного белка METTL3, над которым я работала два
месяца ради того, чтобы обнаружить, что он не влияет на
трансляцию.
Выравнивание (скачать)
METTL3 человека и шимпанзе. Для анализа использовалось: infoalign
mettl3_alignment.fa -only -name -seqlength -gaps -idcount -diffcount -heading -html
mettl3_alignment.infoalign
Name
Sequence Length
Gaps
Identity
Difference
homo_sapiens_1-13243
13210
7
13210
0
pan_troglodytes_1-13243
13228
6
13079
149
Различие: 1.1%. Полногеномные отличия между шимпанзе и человеком оцениваются в
1.3% (ссылка).
Более подробная информация представлена на рис.2 и взята из статьи
(ссылка).
Как мы видим, отличие METTL3 человека и шимпанзе находится в рамках нормы.