файл с ID: list34.txt, всего 15 ID
все ID участвовали в анализе обогащения
в выдаче оказалось 63 GO terms, потому что именно у такого количества GO terms
False discovery rate (FDR) < 0.05
10 самых значимых GO terms: coenzyme A biosynthetic process(GO:0015937),
coenzyme metabolic process(GO:0006732), coenzyme A metabolic
process(GO:0015936), purine nucleoside bisphosphate biosynthetic process
(GO:0034033), ribonucleoside bisphosphate biosynthetic process (GO:0034030),
nucleoside bisphosphate biosynthetic process (GO:0033866), nucleoside
bisphosphate biosynthetic process (GO:0033866), ribonucleoside bisphosphate
metabolic process (GO:0033875), nucleoside bisphosphate metabolic process
(GO:0033865), cofactor metabolic process (GO:0051186)
Рёбра графа означают отношение принадлежности путей.
Видимо, белки из моего списка участвуют в синтезе и процессинге кофермента А
(есть пути, непосредственно связанные с коэнзимом А, а также множество
обогащенных путей, связанных с нуклеозиддифосфатами (коэнзим А тоже отчасти
нуклеозиддифосфат)).
String
Для всех белков указано наличие 3D структур
Узлы графа связаны:
Known Interactions: from curated databases, experimentally determined
Predicted Interactions: gene neighborhood, gene co-occurrence
Others: textmining, co-expression
ID консервативны для эукариот, в особенности для Opistokonta.
Коэкспрессия очень низкая, особенно у человека.
после нажатия на more к графу добавляются новые белки, и он приобретает вид
более структурированной сети. после одного нажатия в графе появилась связь gene
co-occurrence, а protein homology, как я ни старалась, я не нашла
