Исследование доменной структуры SODF_ECOLI с помощью Pfam

Слева изображена доменная структура SODF_ECOLI. В белке обнаружено 2 домена:

Sod_Fe_N — N-концевой, показан зелёным цветом
Sod_Fe_C — C-концевой, показан красным цветом

Краткое описание доменов

идентификатор Pfam	сокращенное название	полное название на русском языке	положение домена в последовательности
PF00081	Sod_Fe_N	Fe/Mn супероксид дисмутаза, альфа-спиральная шпилька	1– 81
PF02777	Sod_Fe_C	Fe/Mn супероксид дисмутаза, C-концевой домен	85 – 190

Изображение положения доменов в 3D-структуре

Идентификатор файла PDB: 1isa

Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен SODF_ECOLI

Надцарство	Таксон	Количество белков с доменом PF00081(Sod_Fe_N)
Эукариоты	Растения	76
Эукариоты	Грибы	87
Эукариоты	Животные	71
Бактерии	Все	738
Археи	Все	27

Всего известно белков с доменами Sod_Fe_N: 1180
Домен Sod_Fe_N встречается в белках в сочетании с другими доменами чаще, чем один.
Случаи дупликации домена Sod_Fe_N неизвестны.
Cлучаи перестановки 2-х доменов местами, если один из доменов — Sod_Fe_N, неизвестны.

Супероксид дисмутазы (SOD) катализируют перевод супероксид-радикалов в перекись водорода и молекулярный кислород. Известны 3 семейства супероксид дисмутаз, одна из которых — Mn/Fe-связывающее.У человека есть цитоплазматическая Cu/Zn SOD и митохондриальная Mn/Fe SOD. N-концевой домен — длинная антипараллельная альфа-спиральная шпилька.