Данные банка Swiss-Prot о белке SODF_ECOLI
Характеристика
Метка поля
Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа
AC
P09157
Стандартное имя последовательности
(идентификатор последовательности)
ID
SODF_ECOLI
Название белка, отражающее его функции
DE
Fe-зависимая Супероксид дисмутаза (EC 1.15.1.1)
Дата создания документа
DT
01 марта 1989г.
Дата последнего исправления аннотации
DT
01 февраля 2005г.
Название организма
OS
Escherichia coli, Escherichia coli O6,
Escherichia coli O157:H7,
Shigella flexneri.
Полное название таксона
OC
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности
SQ
192 а.о.
Молекулярная масса белка
SQ
21135 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа
RN
14
Название журнала с самой свежей публикацией
RL
Infect. Immun. 71:2775-2786(2003).
Описание вторичной структуры
FT
Имеется описание, где слева указаны элементы вторичной структуры (альфа-спираль - HELIX, бета-тяж - STRAND, поворот - TURN), во втором и третьем столбцах - начало и конец каждого элемента вторичной структуры соответственно.
Что содержит поле комментариев?
CC
Какие особенности последовательности указаны?
FT
1. Является ли метионин инициирующей аминокислотой (INIT_MET): в нашем случае - да.
2.Участки, связывающие металл (METAL) - остатки 26, 73, 156, 160 связывают железо.
3.Данные о втроричной структуре.
Идентификатор файла PDB
DR
Приведено 3 PDB-кода: 1ISA, 1ISB, 1ISC.
Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка SODF_ECOLI
Таксон
Запрос
Количество найденных документов
Археи (Archaea)
((((([uniprot-Description:superoxide*] & [uniprot-Description:dismutase*]) & [uniprot-Description:fe*]) & [uniprot-Description:1.15.1.1*]) | [uniprot-Description:superoxide dismutase* fe* 1.15.1.1*]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea*])
7
Бактерии (Bacteria)
((((([uniprot-Description:superoxide*] & [uniprot-Description:dismutase*]) & [uniprot-Description:fe*]) & [uniprot-Description:1.15.1.1*]) | [uniprot-Description:superoxide dismutase* fe* 1.15.1.1*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*])
78
Эукариоты (Eukaryota)
((((([uniprot-Description:superoxide*] & [uniprot-Description:dismutase*]) & [uniprot-Description:fe*]) & [uniprot-Description:1.15.1.1*]) | [uniprot-Description:superoxide dismutase* fe* 1.15.1.1*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*])
10