Количество спиралей | Количество β-тяжей | Количество реверсивных поворотов | Количество водородных связей |
13 (α-спиралей) | 23 | 23 | 197 |
Мой белок принадлежит к классу α/β так как в нём присутствуют и β-тяжи, и α-спирали. Чередования, на мой взгляд, здесь не имеется.
моя α-спираль: 188-207 остаток.
мой параллельный β-тяж: 173-180 и 214-218.
мой антипараллельный β-тяж: 244-247 и 262-265
петля на 180 градусов поворачивается на участке 31-35
На мой взгляд, паттерн водородных связей представляет собой H(i,i+3)
Бетта-тяжи
Бетта-поворот
Данный поворот образуют остатки LYS30, TRP31, ASP32, SER33, ASP34, GLY35. Имеется водородные связи между кислородом 31 остатка и азотами 35,34 и 33 остатка.