На главную

Описание контактов лиганда

ГИСТИДИЛ-АДЕНОЗИН МОНОФОСФАТ

Лиганд (в шарнирной модели) и связанние с ним атомы аминокислотных остатков (в проволочной модели).

Имя атома остатка белка Имя атома лиганда Расстояние Предположительная природа контакта
GLU131A.OE HAM450A.NE 3.282 Водородная связь
TYR288A.CD HAM450A.CE 4.508 Гидрофобная связь
ARG113A.NH2 HAM450A.O2P 2.480 Водородная связь
GLN127A.NE2 HAM450.O 2.911 Водородная связь
PHE125A.CD2 HAM450A.C4 3.333 Гидрофобная связь
PHE125A.CE2 HAM450A.C5 4.138 Гидрофобная связь
PHE125A.CD1 HAM450A.C6 3.742 Гидрофобная связь
PHE125A.CB2 HAM450A.C2 3.423 Гидрофобная связь
TYR122A.O HAM450A.N6 2.732 Водородная связь
ARG311A.CZ HAM450.C2 3.893 Гидрофобная связь
TYR263A.OH HAM450A.N 2.876 Водородная связь
TYR264.OH HAM450A.ND1 2.639 Водородная связь
GLU83.OE1 HAM450A.N 2.648 Водородная связь
ARG259A.NH2 HAM450A.O3P 3.000 Водородная связь
TYR122A.O HAM450A.N6 2.732 Водородная связь
GLU115A.OE1 HAM450A.N6 2.783 Водородная связь
THR281A.O HAM450A.*HO2 3.655 Водородная связь
TYR122A.O HAM450A.N6 2.732 Водородная связь

Проект генноинженерного эксперимента

Чтобы увеличить сродство белка к лиганду, можно заменить аргинин (311, цепь А) на фенилаланин, т.к. его гидрофобные свойства выражены более ярко за счёт бензольного кольца.

Чтобы уменьшить сродство белка к лиганду, можно заменить тирозин (263, цепь А) на фенилаланин, который будет осуществлять все те же связи, кроме водородной связи OH-N.

Замена глутаминовой кислоты (131, цепь А) на аспарагиновую слабо изменит силу взаимодействия).

На главную


© Даниленко Светлана