Описание контактов лигандаГИСТИДИЛ-АДЕНОЗИН МОНОФОСФАТ |
Лиганд (в шарнирной модели) и связанние с ним атомы аминокислотных остатков (в проволочной модели).
Имя атома остатка белка | Имя атома лиганда | Расстояние | Предположительная природа контакта |
GLU131A.OE | HAM450A.NE | 3.282 | Водородная связь |
TYR288A.CD | HAM450A.CE | 4.508 | Гидрофобная связь |
ARG113A.NH2 | HAM450A.O2P | 2.480 | Водородная связь |
GLN127A.NE2 | HAM450.O | 2.911 | Водородная связь |
PHE125A.CD2 | HAM450A.C4 | 3.333 | Гидрофобная связь |
PHE125A.CE2 | HAM450A.C5 | 4.138 | Гидрофобная связь |
PHE125A.CD1 | HAM450A.C6 | 3.742 | Гидрофобная связь |
PHE125A.CB2 | HAM450A.C2 | 3.423 | Гидрофобная связь |
TYR122A.O | HAM450A.N6 | 2.732 | Водородная связь |
ARG311A.CZ | HAM450.C2 | 3.893 | Гидрофобная связь |
TYR263A.OH | HAM450A.N | 2.876 | Водородная связь |
TYR264.OH | HAM450A.ND1 | 2.639 | Водородная связь |
GLU83.OE1 | HAM450A.N | 2.648 | Водородная связь |
ARG259A.NH2 | HAM450A.O3P | 3.000 | Водородная связь |
TYR122A.O | HAM450A.N6 | 2.732 | Водородная связь |
GLU115A.OE1 | HAM450A.N6 | 2.783 | Водородная связь |
THR281A.O | HAM450A.*HO2 | 3.655 | Водородная связь |
TYR122A.O | HAM450A.N6 | 2.732 | Водородная связь |
Чтобы уменьшить сродство белка к лиганду, можно заменить тирозин (263, цепь А) на фенилаланин, который будет осуществлять все те же связи, кроме водородной связи OH-N.
Замена глутаминовой кислоты (131, цепь А) на аспарагиновую слабо изменит силу взаимодействия).