The Human Protein Atlas

Выданные ID: AGPAT1 AGPAT2 AGPAT3 AGPAT4 AGPAT5 CEL DGAT1 DGAT2 GNPAT GPAM GPAT2 GPAT3 GPAT4 LIPC LIPF LIPG LPL MBOAT2 MGLL MOGAT1 MOGAT2 PLA2G3 PNLIP PNLIPRP1 PNPLA3

В данном практикуме я решила познакомиться с проектом The Human Protein Atlas, а точнее с помощью его возможностей изучить продукт гена MGLL.

Ген MGLL кодирует сериновую гидролазу из суперсемейства AB гидролаз, которая катализирует гидролиз моноацилглицеридов до свободной жирной кислоты и глицерина. Кодируемый белок играет важную роль в ряде физиологических процессов, включающих восприятие боли посредством гидролиза эндоканнабиноида 2-арахидоноилглицерина. Экспрессия этого гена может играть роль в опухолеобразовании и метастазировании рака. Для получающегося транскрипта возможен альтернативный сплайсинг, поэтому известно о ряде изоформ данного гена.

Эспрессия в различных отделах мозга

В этом разделе представлено комплексное пространственное профилирование мозга, а именно транскриптомные данные в сочетании с аффинной локализацией белков in situ. Представленные в разделе данные относятся не только к генам человека, но и к их ортологам у свиней и мышей.

Рассматриваемый ген экспрессируется во всех отделах мозга человека, специфичности практически не наблюдается.

Клеточная локализация

Раздел Subcellular предоставляет сведения об экспрессии и пространственном распределении белков. Для каждого гена субклеточное расположение белка было исследовано методом иммунофлуоресценции и конфокальной микроскопии в трех различных клеточных линиях.

Продукт гена MGLL специфически локализован в нуклеоплазме клетки.

Эспрессия в различных тканях

Этот раздел посвящен профилям экспрессии генов в тканях человека как на уровне мРНК, так и на уровне белков. Данные об экспрессии белков в 44 типах тканей человека получены на основе профилирования белков с помощью иммуногистохимии.

Ген экспрессируется повсеместно с вариациями по интенсивности. Так, наибольшая экспрессия белка представлена в мозге и пищеварительной системе (желудок и кишечник). В то время как соответствующая РНК экспрессируется больше всего в передних отделах пищеварительного тракта и в жировой ткани. В большинстве тканей экспрессия РНК соразмерна экспрессии белка, но в мышцах и пищеводе уровень экспрессии РНК значительно превышает таковой для белка.

Патологии

Этот раздел содержит информацию о патологиях, основанную на данных экспрессии мРНК и белков различных форм рака человека, а также миллионы изображений срезов тканей, окрашенных иммуногистохимическим методом и графики Каплана-Мейера, показывающие корреляцию между экспрессией мРНК каждого гена человеческого белка и выживаемостью раковых больных.

Для рассматриваемого гена было показано, что экспрессия мРНК является прогностически значимой для выживаемости пациентов с раком поджелудочной железы (неблагоприятный маркер). То есть высокая экспрессия неблагоприятна при раке поджелудочной железы.