ID: Rep_trans
AC: PF02486
Summary name: Replication initiation factor
Последовательностей в выравнивании seed: 34
Структуры: 8
Проект Jalview| Таблица 11-3 | Информация | Комментарии |
|---|---|---|
| Выравнивание seed | 34 последовательности в seed 25 последовательностей в Jalview 245 колонок в выравнивании | |
| МДБ-all | 5-9 | |
| 100% консервативные колонки в МДБ-all | 5:R; 7:D; 9:A | Окрашивание Clustal + Above Identity Threshold 90% |
| МДБ-notAll | колонки 81-109 последовательности 5, 6, 8-10 | В блоке 20 консервативных позиций |
| 100% консервативные колонки в МДБ-notAll | 81:[IL]; 82:G; 83:S; 86:S; 87:[DE]; 88:[LV]; 89:Y; 91:C; 93:Y; 95:K; 97:Y; 98:E; 99:Q; 100:Y; 101:[AVI]; 102:K; 105:I; 107:[VLI]; 108:[DE]; 109:[DE] | Мы наткнулись на довольно консервативный участок, каких в выравнивании этих 5 последовательностей много. |
| Участок выравнивания, не отражающий ход эволюции | колонки 154-181 | Здесь окраска колонок только при очень низких процентах Conservation (около 20) и много гэпов. |