Поиск мотива сайта разрывной транскрипции sgRNA
Я решила работать с геномом Betacoronavirus HKU24, найденным в NCBI по поиску Coronaviridae. Геном
Последовательности для входного файла были найдены вручную с помощью SnapGene: я взяла upstream последовательности (перед каждым геном).
Входной файл
Выдача МЕМЕ
Мотив с лучшим e-value (4.8e-001) был найден в 7 из 10 последовательностях
![]()
![]()
С помощью FIMO построена pwd