Торсионные углы

Изображены карты Рамачандра для цепи А (диаграмма 1) и упомянутого мной выше элемента вторичной структуры (диаграмма 2) протеазы VII E.coli.

Диаграмма 1


Диаграмма 2

Наиболее типичные торсионные углы для остатков моего элемента: "фи" – от -170 до -78, "пси" - от 130 до 174. Эти значения характерны для бета-структур, что соответствует PDB-файлу и картинкам.
Три точки, сильно выпадающие из этих значений также соответствует бета-слою, так как, на самом деле, они находятся недалеко от остальных (угол -180 градусов равен углу 180 градусов). Интересно заметить, что все три точки соответствуют остаткам глицина.

Основное скопление точек в полипептидной цепи А лежит в пределах "фи" - от -180 до -45, "пси" - от 90 до 180. Это углы остатков бета-тяжей.



© Айдарханов Руслан 2008