Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
Фрагмент последовательности | H-A-I-C-E-N-C-G-K-I-V-D-F | 1 | Нет. Найден только мой белок |
Сильный | H-[ALFI]-[VI]-C-[DANQ]-[CLV]-C-G-[EK]-[VTI]-[IKV]-[ED]-[FI] | ... | ... |
Слабый | [VILM]-[CM]-[DANQ]-[CLVI]-[CM]-[GALIV]-[EKDR]-[VTIL]-[IKVL] | ... | ... |
Слабый паттерн получен путем его сокращения на 2 позиции с каждого из концов,в одном случае-запрет на маленькие остатки, в других-модификация,исходя из родственных свойств аминокислотных остатков.
Все описанные в PROSITE мотивы в заданном белке PERR_BACSU
Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |
... | ... | ... | ... | ... | ... | ... |