Описание аденозил-хлорид синтазы из генома бактерии Salinispora tropica CNB-440 .

Отчёт о белке

Мной был изучен белок аденозил-хлорид синтаза из генома бактерии Salinispora tropica CNB-440. найденные на сайте NCBI. Данные о белке и его гене, найденные на сайте NCBI, приведены в таблице 1.

Таблица 1. Описание аденозил-хлорид синтазы из генома бактерии Salinispora tropica CNB-440.
Идентификатор белка ABP53500.1
Идентификатор генома CP000667.1
Название белка Adenosyl-chloride synthase
Координаты гена в геноме 1162700..1163551
Длина гена (п.н.) 852
Цепь обратная
Длина белка (а.о.) 283

Для получения последовательности белка мы находим его в базе данных NCBI и копируем её в файл FASTA. Последовательность белка

У бактерии он катализирует первую стадию каскада реакций, ведущего к биосинтезу ингибитора протеасомы salinosporamide A.

Геномное окружение белка

Мной был изучен ген кодирующий данный белок с помощью базы данных NCBI (был совершен поиск по типу Nucleotide и найден нужный ген по его координатам в Graphics). Геномное окружение гена данного белка приведено на рисунке 1.

image
Рисунок 1. Геномное окружение гена белка аденозил-хлорид синтазы (идентификатор белка ABP53500.1 ]). Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI. Красные строки -это гены, а стрелки - направление их транскрипции.

В данной работе был изучиен белок аденозил-хлорид синтазу: выявлены его функции и составлено его описание. Также было найден ген, кодирующий данный белок, его нуклеотидная последовательность и геномное окружение.