Описание аденозил-хлорид синтазы из генома бактерии Salinispora tropica CNB-440 .
Отчёт о белке
Мной был изучен белок аденозил-хлорид синтаза из генома бактерии Salinispora tropica CNB-440. найденные на сайте NCBI. Данные о белке и его гене, найденные на сайте NCBI, приведены в таблице 1.
Идентификатор белка | ABP53500.1 |
---|---|
Идентификатор генома | CP000667.1 |
Название белка | Adenosyl-chloride synthase |
Координаты гена в геноме | 1162700..1163551 |
Длина гена (п.н.) | 852 |
Цепь | обратная |
Длина белка (а.о.) | 283 |
Для получения последовательности белка мы находим его в базе данных NCBI и копируем её в файл FASTA. Последовательность белка
У бактерии он катализирует первую стадию каскада реакций, ведущего к биосинтезу ингибитора протеасомы salinosporamide A.
Геномное окружение белка
Мной был изучен ген кодирующий данный белок с помощью базы данных NCBI (был совершен поиск по типу Nucleotide и найден нужный ген по его координатам в Graphics). Геномное окружение гена данного белка приведено на рисунке 1.
В данной работе был изучиен белок аденозил-хлорид синтазу: выявлены его функции и составлено его описание. Также было найден ген, кодирующий данный белок, его нуклеотидная последовательность и геномное окружение.