# |
Длина связи (Å) |
Угол N-H-O (°) |
|
Альфа-спираль | |||
1 |
N(70ILE)-O(66ASP) |
2.88 |
165.6 |
2 |
N(71SER)-O(67GLU) |
2.89 |
154.7 |
3 |
N(72LYS)-O(68ASP) |
2.93 |
153.6 |
Бета-тяжи | |||
1 |
N(4ILE)-O(17ILE) |
2.87 |
155.6 |
2 |
N(17ILE)-O(4ILE) |
2.86 |
149.7 |
3 |
N(6LEU)-O(15VAL) |
2.81 |
156.6 |
Молекула 3wcq является мутировавшим ферродоксином d58n, который более активно принимает участие в процессе транспорта электронов по сравнению с молекулой, выделенной из одноклеточной крсной водоросли Cyanidioschyzon merolae.[3] Cреднее расстояние между атомами азота и кислорода в α-спирали равно 2.9Å, в β-листе - 2.85Å. Полученная величина не противоречит допустимому диапозону расстояний между донором и акцептором протона (2,5-3,2 по [1]). Cредние значение уголов N-O-C в α-спирали равно 157,97°, в β-листе - 153,97°. Полученные данные также укладываются в интервал допустимых значений ( 135° - 180° по [2]). Таким образом, параметры водородных связей в исследованных элементах вторичной структуры являются типичными для белков.
Ссылка на скриптИсточники:
1.Professor David A. Evans group seminar on Noncovalent interactions: An Introduction to Hydrogen Bonding (2009)