В этом практикуме мы поняли, как различные мутации влияют последовательность белка. Для этого из NCBI были получены последовательности белка ABP53500.1 и геном бактерии Salinispora tropica CNB-440. Из генома с помощью seqret была получена кодирующая последовательность данного белка. Затем в этой последовательности вручную в текстовом редакторе совершались мутации, и она транслировалась в белковую с помощью transeq. После этого с помощью needle было получено выравнивание последовательностей с мутациями относительно исходной. Результаты были визуализированы в Jalview.
Мутации в различных частях кодирующей последовательности могут приводить к разным изменениям в последовательности белка: миссенс-, носсенс- и синонимичным мутациям, а также к сдвигу рамки считывания и или выпадению аминокислот.
Таблица Мутация 1 Мутация 2 Мутация 3 Мутация 4 Мутация 5 Мутация 6 Мутация 7 Мутация 8 Мутация 9 Мутация 10 Мутация 11