Желчно-кислотно-натриевые симпортеры участвуют в энтерогепатической циркуляции желчных кислот. Два гомологичных переносчика участвуют в реабсорбции желчных кислот. Один из них поглощает желчные кислоты из просвета кишечника, желчного протока и верхушки почки (котранспортер желчных кислот). Другой - это белок, который экспрессируется в базолатеральных мембранах гепатоцитов (NTCP). Как котранспортер, NTCP связывает два иона натрия и одну (конъюгированную) молекулу желчной соли, тем самым обеспечивая приток желчных солей в печень. Другие транспортируемые молекулы - это стероидные гормоны, гормоны щитовидной железы и различные ксенобиотики.
Были обнаружены 8 трансмембранных хеликаз длиной примерно 22 аминокислотных остатка. Вероятность того, что N-домен белка находится на внутренней стороне мембраны - 0.239%. Больше всего выделяются трансмембраные участки, имеющие наибольшую вероятность.
Затем, с помощью сервиса PDBTM была представлена структура данного фермента. На картинке фермент представлено 2 NTCP.
Было посчитано максимальное значение F1-score: 0,711297 . Ему соответствовала 287 позиция в таблице В результате был определён оптимальным порог score по соотношению чувствительности и точности: 749.30 Также все найденные последовательности с нашей архитектурой были приняты тестом. Это говорит о высокой консервативности и, возможно, специфичности данной архитектуры.