Выполнено с помощью алгоритма maximum liklelihood
((((((Q8Y8B1_LISMO,CLPE_BACSU),Q1GB74_LACDA),(CLPL_STAA8,(M4YWY5_STREQ,Q1G869_LACDA))),(Q5L436_GEOKA,(M4YZ72_STREQ,A0A0H2USJ7_STRPN))),((HSLU_LACDA,HSLU_LISMO),(HSLU_STAA8,(CLPY_BACSU,HSLU_GEOKA)))),((Y1413_STAA8,Q5KZ67_GEOKA),(Q1GAP8_LACDA,(CLPX_CLOTE,(CLPX_STAA8,(CLPX_STRPN,(CLPX_LISMO,(CLPX_GEOKA,CLPX_BACSU))))))),((Q5KUR3_GEOKA,Q895L6_CLOTE),(Q898D1_CLOTE,(Q891B9_CLOTE,(Q899H3_CLOTE,(((M4YVJ8_STREQ,FTSH_STRPN),Q1GBN8_LACDA),(Q8YAC6_LISMO,(Q5L3T1_GEOKA,Q891B9_CLOTE))))))));
Паралоги: CLPX_GEOKA + Q5KZ67_GEOKA; Q898D1_CLOTE + Q891B9_CLOTE; CLPL_STAA8 + HSLU_ STAA8
Ортологи: CLPX_ STAA8 + CLPX_STRPN; HSLU_LACDA + HSLU_LISMO; FTSH_STRPN + M4YVJ8_STREQ
ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX Протеаза ClpP является основным участником системы контроля качества митохондриального белка и удаления поврежденных или неправильно свернутых белков в митохондриальном матриксе.
Есть для всех, кроме STRP1. Дерево немного отличается (STRPN и STAAR (STAA8) расположены в обратном порядке).
АTP-dependent protease ATPase subunit HSLU.
Протеосомоподобный комплекс; эта субъединица обладает активностью шаперона. Связывание АТФ и его последующий гидролиз с помощью HslU имеют важное значение для развертывания белковых субстратов, которые впоследствии гидролизуются с помощью HslV. HslU распознает N-концевую часть своих белковых субстратов и раскрывает их до того, как они направляются в HslV для гидролиза.
Нет для STRP1, STRPN, CLOTE. LISMO и STAAR (STAA8) расположены в обратном порядке
ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH. Действует как процессивная, АТФ-зависимая металлопептидаза цинка как для цитоплазматических, так и для мембранных белков. Играет роль в контроле качества интегральных мембранных белков.
Для всех видов, кроме BACSU, STAA8 (STAAR). Дерево полностью соответствует настоящему поддереву для данных видов