УЧЕБНЫЙ САЙТ ОСИПОВА ДМИТРИЯ, 2010

карта Рамачандрана

Таблица. Измерение торсионных углов остатка Phe10 в белке TAGD_BACSU, цепь А

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках – название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. A –C9 THR9:A.C карбонильная группа
  2. B– N10 PHE10:A.N
  3. C-Ca10 PHE10:A.CA
  4. D-C10 PHE10:A.C карбонильная группа
N9 - Cα9 48.96
ψ
  1. A– N10 PHE10:A.N
  2. B-Ca10 PHE10:A.CA
  3. C-C10 PHE10:A.C карбонильная группа
  4. D-N11 ASP11:A.N
Cα9 – C10; 55.42
ω
  1. A-Ca10 PHE10:A.CA
  2. B-C10 PHE10:A.C карбонильная группа
  3. C-N11 ASP11:A.N
  4. D-Ca11 ASP11:A.CA
C10 -N11; -178.40

Торсионный угол φ

Карты Рамачандрана для аминокислотных остатков белка TAGD_BACSU:

  1. для всех аминокислотных остатков белка TAGD_BACSU
  2. для остатков пролина белка TAGD_BACSU
  3. для остатков глицина белка TAGD_BACSU
  4. для остатков в α-спиралях белка TAGD_BACSU
  5. для остатков в β-листах белка TAGD_BACSU