Определение паралогов и ортологов в семействе глобинов |
![]() |
Дерево имеет три отчетливо выделяющиеся группы ( отмечены на рисунке).К одной из них относятся миоглобины(в левом верхнм углу).Все белки которые находятся с разных сторон от этой группы, если относятся к одному геному, то скорей всего являются парологами. По двум другим мы не можем дать данных. Хорошо видны кластеры Human-Horse -Chiken.Белки из организмов Danio И Xenopus не образуют самостоятельных кластерьв.На дереве видны четыре группы ортологов(отмечены разным цветом).Глобин из Danio может с равной вероятностью относиться как к первой группе ортологов, так и ко второй. . При отдельном рассмотении : Chiken являются между собой парологами. Но если тех, которые закрашены зеленым и розовым, то говорить о том, что они наверняка парологи сложно ,т.к. слишком маленькие длины внутренних ветвей, разделяющие их. Аналогично с таксоном представителя Horse, которые закрашены каричневым, розовым и желтым. В случае с Human закрашенным желтым, он является парологом по отношению ко всем другим анологичным белкам. Danio наверняка являются парологами,как и Xenopus. На рисунке порологи отмечены синим. Все остольные являются ортологами |
![]() |
Данное дерево противоречит представлениям об эволюции на ранних этапах развитяи жизни, т.к. тогда бы Archaea и Bacter на дереве были изображены как организмы, произошедшие от одного предка и которые разошлись в эволюции, сформировав два из трех самых крупных доменов клеточных организмов.Но на данном дереве расположение оргонизмов не соответсвует истинной таксономии.Причиной этого может являтся горизонтальный перенос и организмы Termotoga, Pasteurella, Escherichia могли преобрести глутаминсинтетазу с помощью этого механизма от Archaea уже после расхождения групп в процессе эволюции. |
Back HOME |