Карта Рамачандрана


Работа с программами:

Excel, RasMol






Бета-тяжи

С помощью логических функций Excel было найдено несколько фрагментов последовательности, в которых все остатки имеют углы: -150<фи<-70 и 100<пси<170.

Эти фрагменты белковой цепи имеют вид прямых отрезков и называются бета-тяжами. Несколько бета-тяжей, расположенных параллельно друг другу, образуют бета-лист путем образования водородных связей между атомами их основных цепей.

В моем белке 36 бета-тяжей (в димерной форме).

В белке есть и параллельные, и антипараллельные бета-тяжи.



Альфа-спирали

Еще было найдено несколько участков белка, в которых аминокислотные остатки имеют другие торзионные углы: -75<фи<-15 и -60<пси<-35.

Эти участки имеют вид спиралей, которые называются альфа-спиралями. Они формируются также за счет образования водородных связей между атомами основной цепи соседних витков.

В димерной форме моего белка альфа-спиралей 35.



Главная страница