База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых домено.Содержит их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ
Основываясь на базу данных PFAM в белке LacI_Ecoli существует 2 домена. (+ ещё 1 из SMARTa -он перекрывается с доменами из PFAM)
Изображение доменной структуры LacI_Ecoli:
Описание доменов:
1. Домен №1
Название : LacI Расположение : 4-29 Идентификатор записи в PFAM : PF00356 Краткое описание свойств домена : ДНК-связывающий домен
2. Домен №3
Название : Peripla_BP_1 Расположение : 68-327 Идентификатор записи в PFAM : PF00532 Краткое описание свойств домена : связывается с сахаром(лактозой) и изменяет способность домена LacI связываться с ДНК
Рис.1 Красным цветом отмечен домен LacI1 , желтым - Peripla_BP_ .
Back
HOME