Контрольная.
Создаю профиль для поиска RdRP на основе фрагмента выравнивания из контрольной.
Провожу поиск по большой группе вирусных последовательностей (устанавливаю пороговое значение веса 1).
Файл Excel с результатами поиска.
За погоровое значение веса беру 4.35 (при таком значении минимальна сумма ошибок первого и второго рода ):
| RdRP | Не RdRP | Всего |
Предсказание RdRP | 87 | 3 | 90 |
Предсказание не RdRP | 158 | 1996 | 2154 |
Всего | 245 | 1999 | 2244 |
Вычисляю:
Общее число | 90 |
Процент ошибок | 3,333333333 |
Чувствительность | 35,51020408 |
Специфичность | 99,84992496 |
ROC-кривая: