Контрольная.
Создаю профиль для поиска RdRP на основе фрагмента выравнивания из контрольной.
Провожу поиск по большой группе вирусных последовательностей (устанавливаю пороговое значение веса 1).
Файл Excel с результатами поиска.
За погоровое значение веса беру 4.35 (при таком значении минимальна сумма ошибок первого и второго рода ):
| RdRP | Не RdRP | Всего |
| Предсказание RdRP | 87 | 3 | 90 |
| Предсказание не RdRP | 158 | 1996 | 2154 |
| Всего | 245 | 1999 | 2244 |
Вычисляю:
| Общее число | 90 |
| Процент ошибок | 3,333333333 |
| Чувствительность | 35,51020408 |
| Специфичность | 99,84992496 |
ROC-кривая: